RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CREG2Q8IUH2 290 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ELMOD1Q8N336 334 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 STKLD1Q8NE28 680 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.31□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 RNF139Q8WU17 664 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 NT5C3BQ969T7 300 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MYRFLQ96LU7 910 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MCEEQ96PE7 176 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SMOQ99835 787 aa7.31□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.31□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CA14Q9ULX7 337 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 NME7Q9Y5B8 376 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CLUHO75153 1309 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 A0A0U1RQJ8 604 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 HHLA1C9JL84 531 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 F8VP50 259 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CLDN5O00501 218 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TNFRSF10BO14763 440 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DAB1O75553 588 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LTFP02788 710 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 HCAR3P49019 387 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RGS7P49802 495 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC14Q49A88 953 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DCAF6Q58WW2 860 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RTP2Q5QGT7 225 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LEMD2Q8NC56 503 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KCTD6Q8NC69 237 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 GPR152Q8TDT2 470 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RABGGTAQ92696 567 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SHDQ96IW2 340 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KCNK16Q96T55 309 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PIDD1Q9HB75 910 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 STIM2Q9P246 746 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 USP18Q9UMW8 372 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TFR2Q9UP52 801 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SPTBN2O15020 2390 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 MTMR11A4FU01 709 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 KRIT1O00522 736 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 C2CD2LO14523 706 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PRRG1O14668 218 aa7.29□□□□□ -1.24
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