RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGR2O95994 175 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNE2O96020 404 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGALS2P05162 132 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP3A4P08684 503 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGFB3P10600 412 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCAM1P13591 858 aa9.24□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARK3P27448 753 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARFIP2P53365 341 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT3AP56704 352 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNMA1Q12791 1236 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITGA7Q13683 1181 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEDD9Q14511 834 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF19Q5T6S3 580 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCTP1Q6DN14 999 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT17Q6IS24 598 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL7BQ6UX53 244 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCINQ9Y6U3 715 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAPK3O43293 454 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B4GALT4O60513 344 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR32O75388 356 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK2P20155 84 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITGB8P26012 769 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CIITAP33076 1130 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRHR1P34998 444 aa9.23□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADCY8P40145 1251 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASP2P42575 452 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTR2P61160 394 aa9.23□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.23□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDHR1Q96JP9 859 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLIC6Q96NY7 704 aa9.23□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDF4Q9BRK5 362 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM140Q9NV12 185 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRN3Q9NYV6 651 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.23□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0Y858 1186 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BQV1 296 aa9.22□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP2C9P11712 490 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AFMP43652 599 aa9.22□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTXN1P60606 82 aa9.22□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCTP2Q6DN12 878 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.22□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.22□□□□□ -0.93
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWA7Q9Y334 891 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELP1O95163 1332 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F2RL2O00254 374 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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