RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 SP8Q8IXZ3 490 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SNX3O60493 162 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SERPINB3P29508 390 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 AP3M2P53677 418 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RAPSNQ13702 412 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SLC5A5Q92911 643 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CNBD2Q96M20 576 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KCNK16Q96T55 309 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SIN3BO75182 1162 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RPS6KA3P51812 740 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NPPAP01160 153 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CHRM3P20309 590 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DRD4P21917 467 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DSG1Q02413 1049 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 C8orf48Q96LL4 319 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CBX3Q13185 183 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SGF29Q96ES7 293 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KLHL2O95198 593 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SREBF1P36956 1147 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PRKCIP41743 596 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TBX4P57082 545 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MAPRE2Q15555 327 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KLHL35Q6PF15 583 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MAGED4Q96JG8 741 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 UBXN8O00124 270 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GJA1P17302 382 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PLD1Q13393 1074 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FAXCQ5TGI0 409 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRT35Q92764 455 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CDC6Q99741 560 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CROTQ9UKG9 612 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ASB14A6NK59 587 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KCNJ2P63252 427 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FUT2Q10981 343 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ACAP1Q15027 740 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 AADACL2Q6P093 401 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 HASPINQ8TF76 798 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 HIC2Q96JB3 615 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 EPHB2P29323 1055 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GTF2H1P32780 548 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NEK3P51956 506 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CARTPTQ16568 116 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TNFRSF25Q93038 417 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PAFAH2Q99487 392 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TBX20Q9UMR3 447 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NCAM1P13591 858 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CDC16Q13042 620 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF614Q8N883 585 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CERKQ8TCT0 537 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.87□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MED15Q96RN5 788 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms