RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK16Q00536 496 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MROH9Q5TGP6 573 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NAT14Q8WUY8 206 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS45Q9NRW7 570 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CD274Q9NZQ7 290 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DGAT1O75907 488 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL18O94889 574 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TPBGLP0DKB5 382 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ME2P23368 584 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC26A3P40879 764 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GALK1P51570 392 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SFRP1Q8N474 314 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 APOPT1Q96IL0 206 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ANPEPP15144 967 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB26Q9ULW5 256 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HSF2Q03933 536 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3CBP42338 1070 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 STARP49675 285 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PJA1Q8NG27 643 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ACAP1Q15027 740 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KIZQ2M2Z5 673 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 C5orf22Q49AR2 442 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PROX1Q92786 737 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MCEEQ96PE7 176 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FCHO1O14526 889 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ADSSP30520 456 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ACMSDQ8TDX5 336 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MPZL2O60487 215 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD2P08910 425 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAM1P13591 858 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ALOX12P18054 663 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HELQQ8TDG4 1101 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 C12orf66Q96MD2 445 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 F8W810 466 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CTDNEP1O95476 244 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PCSK1P29120 753 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MCAMP43121 646 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VEPH1Q14D04 833 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF605Q86T29 641 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF33A8MVX0 844 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 F9P00740 461 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FYNP06241 537 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH1A3P47895 512 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH4P55283 916 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EFR3AQ14156 821 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ACAP2Q15057 778 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DENND1BQ6P3S1 775 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GMIPQ9P107 970 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HPSEQ9Y251 543 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LAYNQ6UX15 382 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RDH11Q8TC12 318 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TPST1O60507 370 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF24P17028 368 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TMCO6Q96DC7 493 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087X0T9 212 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM228BP0C875 321 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RBP5P82980 135 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CPNE1Q99829 537 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH9Q9HC56 1237 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP26A1O43174 497 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CLTBP09497 229 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCY1A2P33402 732 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GRK3P35626 688 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BHLHB9Q6PI77 547 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms