RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 RAB27AP51159 221 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 CNTN2Q02246 1040 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 PPATQ06203 517 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 CENPTQ96BT3 561 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINF2P08697 491 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 IL1R1P14778 569 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 YWHAQP27348 245 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 CCT8P50990 548 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 INTS13Q9NVM9 706 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 RGS18Q9NS28 235 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SLITRK3O94933 977 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 DCLK3Q9C098 648 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC1A6P48664 564 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 TPD52L3Q96J77 140 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SEPHS2Q99611 448 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 AKR1A1P14550 325 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 PSMC3P17980 439 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 ACVR2BQ13705 512 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 DPY30Q9C005 99 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FMO4P31512 558 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 NAT9Q9BTE0 207 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 HPSEQ9Y251 543 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.89■■□□□ 1.25
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