RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285238.12

ABCC3-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCC3, Length 5,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-201ENST00000285238 IL17AQ16552 155 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 SLC22A9Q8IVM8 553 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 KATNAL2Q8IYT4 538 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 DNAJC19Q96DA6 116 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TMEM237Q96Q45 408 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 PIF1Q9H611 641 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 RAMP2O60895 175 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 FKBP6O75344 327 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 APOC2P02655 101 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 MLNP12872 115 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 CCDC130P13994 396 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 ADORA2AP29274 412 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TBX4P57082 545 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 NCALDP61601 193 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 NR6A1Q15406 480 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 ZNF284Q2VY69 593 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 HIC2Q96JB3 615 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 RRN3Q9NYV6 651 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 MEIS2O14770 477 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TRIM13O60858 407 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 VAPBO95292 243 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 PRKAA1Q13131 559 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 BFSP2Q13515 415 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 TP53BP2Q13625 1128 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 KYQ8NBH2 561 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 PGLYRP2Q96PD5 576 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 KLHL4Q9C0H6 718 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ABCC3-201ENST00000285238 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ALDH2P05091 517 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 KRT8P05787 483 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ADRB2P07550 413 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ATP6V1B2P21281 511 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MAPK1P28482 360 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 SEPT8Q92599 483 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MKL1Q969V6 931 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ACOX2Q99424 681 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MTFR1LQ9H019 292 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 PORCNQ9H237 461 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 THAP1Q9NVV9 213 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RAD54BQ9Y620 910 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ASTN1O14525 1302 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 GOLGA8TH3BQL2 631 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 DDHD2O94830 711 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ADRA1DP25100 572 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RENBPP51606 427 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 CCDC153Q494R4 210 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ZNF470Q6ECI4 717 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 GPR141Q7Z602 305 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 TMPRSS6Q8IU80 811 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RIN3Q8TB24 985 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 BTN2A2Q8WVV5 523 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ACTR8Q9H981 624 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 CAPN10Q9HC96 672 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RNF19AQ9NV58 838 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MEI4A8MW99 385 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 USP12O75317 370 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 CCDC15Q0P6D6 951 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 DPYSL3Q14195 570 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 SPANXN3Q5MJ09 141 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 POU5F2Q8N7G0 328 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 APBA2Q99767 749 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 VTA1Q9NP79 307 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ARMCX1Q9P291 453 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 DCCP43146 1447 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ITGB6P18564 788 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 DNAJB2P25686 324 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 GPC1P35052 558 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 CNTN1Q12860 1018 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 MFSD10Q14728 455 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 SEMA4DQ92854 862 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 STARD7Q9NQZ5 370 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 RCCD1A6NED2 376 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 ZNF682O95780 498 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 KDELR1P24390 212 aa12.89□□□□□ -0.35
ABCC3-201ENST00000285238 OR1E1P30953 314 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms