RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 BNIP3Q12983 259 aa17.28■□□□□ 0.36
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SPCS1-201ENST00000233025 CDCP2Q5VXM1 449 aa17.28■□□□□ 0.36
SPCS1-201ENST00000233025 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.28■□□□□ 0.36
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SPCS1-201ENST00000233025 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 FAM163BP0C2L3 166 aa17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 GARTP22102 1010 aa17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ASIC1P78348 528 aa17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC10Q6PID8 442 aa17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 DYMQ7RTS9 669 aa17.23■□□□□ 0.35
SPCS1-201ENST00000233025 SFR1Q86XK3 245 aa17.23■□□□□ 0.35
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