RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NKX2-8	O15522	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CREB3	O43889	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	JTB	O76095	146 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ALAD	P13716	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ADD2	P35612	726 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RENBP	P51606	427 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TGFB2	P61812	414 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	BFSP2	Q13515	415 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	AAK1	Q2M2I8	961 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CIPC	Q9C0C6	399 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ASB6	Q9NWX5	421 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KIF28P	B7ZC32	967 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175		H0Y3Z8	333 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175		M0QYT0	321 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	IRAK2	O43187	625 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PPP6R2	O75170	966 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PROP1	O75360	226 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	LARGE1	O95461	756 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MT-CO3	P00414	261 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	HSD3B1	P14060	373 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GPD1	P21695	349 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MATN1	P21941	496 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP1	P28562	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GALNS	P34059	522 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CCT5	P48643	541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PRKAA2	P54646	552 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	EFR3A	Q14156	821 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TIGD6	Q17RP2	521 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	P3H1	Q32P28	736 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PPM1E	Q8WY54	764 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAR2	Q96K12	515 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MECR	Q9BV79	373 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	LZTS1	Q9Y250	596 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	INSL6	Q9Y581	213 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	AOX1	Q06278	1338 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175		B9A039	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	BTBD19	C9JJ37	291 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CYP3A4	P08684	503 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CYP21A2	P08686	494 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	IGFBP2	P18065	325 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	THBS4	P35443	961 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	JAK3	P52333	1124 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TLE3	Q04726	772 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GAB1	Q13480	694 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TAF5	Q15542	800 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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