RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PRKAA1Q13131 559 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 E2F4Q16254 413 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 P3H2Q8IVL5 708 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SERAC1Q96JX3 654 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NLNQ9BYT8 704 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SCN3BQ9NY72 215 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ADCY6O43306 1168 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CYP3A4P08684 503 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC130P13994 396 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 GCNT1Q02742 428 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MAP2K5Q13163 448 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 INPP5DQ92835 1189 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NSL1Q96IY1 281 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 VPS50Q96JG6 964 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SENP8Q96LD8 212 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MRIQ9BWK5 157 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFB5O43674 189 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CDH17Q12864 832 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 DEFB106AQ8N104 65 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MLH1P40692 756 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SCNN1GP51170 649 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 POU6F1Q14863 301 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CNDP1Q96KN2 507 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 COPAP53621 1224 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 APBA2Q99767 749 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 GANQ9H2C0 597 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 USP20Q9Y2K6 914 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PGK1P00558 417 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT2P50583 147 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 BCL2L1Q07817 233 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 GPR142Q7Z601 462 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PLD3Q8IV08 490 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SUSD6Q92537 303 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA5Q96PV4 448 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CDH8P55286 799 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ACTR8Q9H981 624 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CCNG1P51959 295 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 SLC6A3Q01959 620 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ADAM32Q8TC27 787 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 MED8Q96G25 268 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PORCNQ9H237 461 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 PADI4Q9UM07 663 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 O00370 1275 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L7P0C7H9 530 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TNNI3P19429 210 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDP1-208ENST00000613122 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 APOA1P02647 267 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 CTNNB1P35222 781 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 MGAT5Q09328 741 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC3Q13217 504 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ADCK1Q86TW2 530 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 RASSF9O75901 435 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 TPBGLP0DKB5 382 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ITGB6P18564 788 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 COPS5Q92905 334 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 PAFAH2Q99487 392 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 RASSF10A6NK89 507 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 OR56A5P0C7T3 313 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 MTA2O94776 668 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 CACUL1Q86Y37 369 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ACTL9Q8TC94 416 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 KLC4Q9NSK0 619 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 AHSPQ9NZD4 102 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms