RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 BTAF1O14981 1849 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KLHL33A6NCF5 533 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ARL5CA6NH57 179 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DFNA5O60443 496 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFA10O95299 355 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ADH1BP00325 375 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 FTH1P02794 183 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 POLBP06746 335 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DRD1P21728 446 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MAPKAPK2P49137 400 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 FIGNQ5HY92 759 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LZICQ8WZA0 190 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 IGSF21Q96ID5 467 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 FAR2Q96K12 515 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SNX27Q96L92 541 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF576Q9H609 170 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 EDARQ9UNE0 448 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SPTLC1O15269 473 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 AP5Z1O43299 807 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 VEGFDO43915 354 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DAB1O75553 588 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CSF2RAP15509 400 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GDI1P31150 447 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PARP15Q460N3 678 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CST9Q5W186 159 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SARM1Q6SZW1 724 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GPR135Q8IZ08 494 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 STK32AQ8WU08 396 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TRABDQ9H4I3 376 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SYCE1LA8MT33 242 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KCNE1P15382 129 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KCNA5P22460 613 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ABL2P42684 1182 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DGKEP52429 567 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NTRK3Q16288 839 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 UBA3Q8TBC4 463 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LHX5Q9H2C1 402 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PP2D1A8MPX8 630 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NRP1O14786 923 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MFAP3LO75121 409 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 AVILO75366 819 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 C1RP00736 705 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CDK4P11802 303 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 EDNRBP24530 442 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TUBP50607 506 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 IL9RQ01113 521 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ARID5BQ14865 1188 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 COLEC12Q5KU26 742 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SV2AQ7L0J3 742 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DEFB123Q8N688 67 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms