RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 MIB1Q86YT6 1006 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SYT12Q8IV01 421 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 YAF2Q8IY57 180 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CHFRQ96EP1 664 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SCLT1Q96NL6 688 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 FNBP1Q96RU3 617 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM209Q96SK2 561 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SYT3Q9BQG1 590 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CSRNP2Q9H175 543 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 STK39Q9UEW8 545 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 F8P00451 2351 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CHADO15335 359 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ORC4O43929 436 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 HBP1O60381 514 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 NOBOXO60393 691 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ATG13O75143 517 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 MOSPD3O75425 235 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 GJB3O75712 270 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 APBB3O95704 486 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 C1RP00736 705 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SCG5P05408 212 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM27P14373 513 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PTPN2P17706 415 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 HOXA9P31269 272 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 OR1D2P34982 312 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RHDQ02161 417 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 DRP2Q13474 957 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 DMC1Q14565 340 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PSMD5Q16401 504 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 VPS53Q5VIR6 699 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ANO7Q6IWH7 933 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 DHRS13Q6UX07 377 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 STK32CQ86UX6 486 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 Q8N1Y9 231 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 WBP1Q96G27 269 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC140Q96MF4 163 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PIGSQ96S52 555 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 RSAD1Q9HA92 442 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PILRBQ9UKJ0 227 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 X6R8D5 127 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 TRIP11Q15643 1979 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD3-210ENST00000561408 PDZD2O15018 2839 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB5O15062 677 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 GJB6O95452 261 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 SERPINF2P08697 491 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 FGRP09769 529 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 MYL4P12829 197 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 LCP1P13796 627 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 TCF3P15923 654 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 THBS2P35442 1172 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 MLH1P40692 756 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 SCNN1GP51170 649 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 GFRA1P56159 465 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 HAND2P61296 217 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 SLFN5Q08AF3 891 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 MTMR1Q13613 665 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 TEAD2Q15562 447 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms