RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	WBP2	Q969T9	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM186A	A6NE01	2351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	TULP2	O00295	520 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ATG13	O75143	517 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	NDUFA10	O95299	355 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZBED1	O96006	694 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	IRF1	P10914	325 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	KRT83	P78385	493 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616		Q6ZNB5	142 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	C12orf40	Q86WS4	652 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SCML4	Q8N228	414 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ACD	Q96AP0	544 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MDM4	O15151	490 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CCP110	O43303	1012 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	STC2	O76061	302 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MME	P08473	750 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC175	P0C221	793 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	RALA	P11233	206 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	GAD2	Q05329	585 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	DMWD	Q09019	674 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ADIG	Q0VDE8	80 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CNGA2	Q16280	664 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SYT13	Q7L8C5	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	MARK1	Q9P0L2	795 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616		A0A087X0T9	212 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616		A0A0A0MRY4	1105 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616		K7EQS6	105 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616		M0QYV0	167 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CACNG3	O60359	315 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	GABBR2	O75899	941 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	KAT7	O95251	611 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	LCA5L	O95447	670 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM228B	P0C875	321 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	GZMA	P12544	262 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CHRNB2	P17787	502 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	CNR2	P34972	360 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	FNTB	P49356	437 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACTN1-215	ENST00000555616	FMO1	Q01740	532 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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