RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FNBP1	Q96RU3	617 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF32	Q9H0A6	362 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61	4e-12	■■■■■ 275.7
ATXN3-231	ENST00000554994	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994		H7C4K7	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PRRG1	O14668	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KLRC4	O43908	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	IL18RAP	O95256	599 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SOD2	P04179	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CTSA	P10619	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LAMP2	P13473	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNE1	P15382	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GART	P22102	1010 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ADSS	P30520	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OR1D2	P34982	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXD13	P35453	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MPL	P40238	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MAGEA9	P43362	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DLG4	P78352	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DSC1	Q08554	894 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAM9	Q13443	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	BIRC3	Q13489	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TRPC3	Q13507	836 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	STIM1	Q13586	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMD5	Q16401	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UPP1	Q16831	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CD302	Q8IX05	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TSG101	Q99816	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OBSL1	O75147	1896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPRD	P23468	1912 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CYB561D2	O14569	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ABLIM1	O14639	778 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PPEF2	O14830	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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