RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 AXIN1O15169 862 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K13O43283 966 aa5.85□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.85□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 SEC13P55735 322 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TBX4P57082 545 aa5.84□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 KDSRQ06136 332 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SULT2A1Q06520 285 aa5.84□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 FZD5Q13467 585 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CRY1Q16526 586 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DPCR1Q3MIW9 517 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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