RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540797.5

USP3-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3, Length 5,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-204ENST00000540797 SOAT1P35610 550 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NR2C2P49116 596 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 IL17AQ16552 155 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 RFX8Q6ZV50 586 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 IFT172Q9UG01 1749 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CSH1P0DML2 217 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CSH2P0DML3 217 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KCNK10P57789 538 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CDH17Q12864 832 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PLCL1Q15111 1095 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 HDCP19113 662 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 BTKQ06187 659 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KCNA10Q16322 511 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PSMD5Q16401 504 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 EPN3Q9H201 632 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SYCE1LA8MT33 242 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PEX10O60683 326 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KLHL2O95198 593 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MSH3P20585 1137 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 INPP5AQ14642 412 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CASZ1Q86V15 1759 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PIK3C2AO00443 1686 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MAGEB16A2A368 324 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NFKBIEO00221 500 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 LYPLA2O95372 231 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KRT16P08779 473 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MPP3Q13368 585 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 IFNEQ86WN2 208 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MYLPFQ96A32 169 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CCDC126Q96EE4 140 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MTMR8Q96EF0 704 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ARIH2O95376 493 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ASGR1P07306 291 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 CACUL1Q86Y37 369 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SUSD6Q92537 303 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 HSFY1Q96LI6 401 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SELPP16109 830 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TPH1P17752 444 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 GLRBP48167 497 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 BCL2L1Q07817 233 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 VAV3Q9UKW4 847 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SPACA6W5XKT8 324 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TOMM70O94826 608 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 HPCAP84074 193 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 LENG9Q96B70 501 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.5
USP3-204ENST00000540797 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 GPAMQ9HCL2 828 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KCNK1O00180 336 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 EFCAB14O75071 495 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 RARGP13631 454 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PRKCQQ04759 706 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 MAML3Q96JK9 1138 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 KLRC4O43908 158 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 GRK3P35626 688 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-204ENST00000540797 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms