RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535811.1

PARPBP-208, Transcript of PARP1 binding protein, human

TSL 2

Gene PARPBP, Length 1,465 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARPBP-208	ENST00000535811	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TBCB	Q99426	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PRY	O14603	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	USP12	O75317	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HOXD12	P35452	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CNGA3	Q16281	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NRAC	Q8N912	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CAND2	O75155	1236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SGPL1	O95470	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	IDUA	P35475	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NDST3	O95803	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	VIP	P01282	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	DRD1	P21728	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TNFSF4	P23510	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NDUFS1	P28331	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF84	P51523	738 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	DMWD	Q09019	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GJA10	Q969M2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	NTN1	O95631	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	GLP2R	O95838	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	TOMM40	O96008	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	CD63	P08962	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARPBP-208	ENST00000535811	SOX2	P48431	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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