RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522115.6

PTPN12-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 5

Gene PTPN12, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-215	ENST00000522115	MOSPD3	O75425	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GSTM5	P46439	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDH17	O14917	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	NPC1	O15118	1278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TP73	O15350	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	USP12	O75317	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ABCB4	P21439	1286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TACR3	P29371	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	HOXD12	P35452	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	GHRHR	Q02643	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CSHL1	Q14406	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CNGA3	Q16281	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-215	ENST00000522115	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115		J3KTA2	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PRY	O14603	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TAF5L	O75529	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SGPL1	O95470	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ITGA5	P08648	1049 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NPPB	P16860	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NDUFS1	P28331	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PPM1A	P35813	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PMM1	Q92871	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115		M0QZQ0	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RRH	O14718	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ANXA6	P08133	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	YY1	P25490	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PTGER1	P34995	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TEC	P42680	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ZNF84	P51523	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	GAB1	Q13480	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	BFSP2	Q13515	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CBFB	Q13951	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ETFDH	Q16134	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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