RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 BIRC5O15392 142 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TNFAIP3P21580 790 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EFNA5P52803 228 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 KCND2Q9NZV8 630 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HESX1Q9UBX0 185 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC12Q9UKB3 198 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN14A8MX76 684 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SPOPO43791 374 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 VTNP04004 478 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 NCKAP1LP55160 1127 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MYBPC1Q00872 1141 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 KCNA1Q09470 495 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SFR1Q86XK3 245 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MBOAT7Q96N66 472 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 A0A088AWK7 358 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 GPR182O15218 404 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CNBD2Q96M20 576 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FUOMA2VDF0 154 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SLC16A4O15374 487 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ADCY6O43306 1168 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RBP3P10745 1247 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RARRES1P49788 294 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PTK6Q13882 451 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 BCL2A1Q16548 175 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD5Q7Z6J6 570 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ACCSQ96QU6 501 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 GPAMQ9HCL2 828 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CROTQ9UKG9 612 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 VAV3Q9UKW4 847 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MYADML2A6NDP7 307 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP42A6NI28 874 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 BANF1O75531 89 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 STAMBPO95630 424 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CLTBP09497 229 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A3Q00325 362 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CETN1Q12798 172 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CCNIQ14094 377 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM60Q495X7 471 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 LENG9Q96B70 501 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 NEURL2Q9BR09 285 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FADS3Q9Y5Q0 445 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 OTOFQ9HC10 1997 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM150BA6NC51 233 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 F2P00734 622 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SLC18A1P54219 525 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ALCAMQ13740 583 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RALGPS1Q5JS13 557 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PACS1Q6VY07 963 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 POMGNT1Q8WZA1 660 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 OSMRQ99650 979 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TREHO43280 583 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJA2O60884 412 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP6O75344 327 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FUCA1P04066 466 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CD48P09326 243 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FDFT1P37268 417 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EPHB1P54762 984 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FAM117BQ6P1L5 589 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SLCO2A1Q92959 643 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 DNAI2Q9GZS0 605 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.43□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms