RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	HPDL	Q96IR7	371 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SDCBP2	Q9H190	292 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SLC32A1	Q9H598	525 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	DPP3	Q9NY33	737 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183		H0Y626	953 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183		K7ESF4	209 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	KCNK3	O14649	394 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	AXIN1	O15169	862 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	GDF9	O60383	454 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	RECQL4	O94761	1208 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MTA2	O94776	668 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM16	O95361	564 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MYBL1	P10243	752 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CEBPB	P17676	345 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	WEE1	P30291	646 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	PAFAH1B1	P43034	410 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	EPHB3	P54753	998 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	EPHA5	P54756	1037 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TNNC1	P63316	161 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TUBB4B	P68371	445 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ROR1	Q01973	937 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	GRM2	Q14416	872 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	UPP1	Q16831	310 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF394	Q53GI3	561 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC181	Q5TID7	509 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF280D	Q6N043	979 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ITIH5	Q86UX2	942 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HASPIN	Q8TF76	798 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MS4A14	Q96JA4	679 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NUP85	Q9BW27	656 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	EHD2	Q9NZN4	543 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NUP205	Q92621	2012 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183		F8W810	466 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CES2	O00748	559 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	PAEP	P09466	180 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	FCAR	P24071	287 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MPL	P40238	635 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ALDH1A3	P47895	512 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MMP16	P51512	607 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CDH8	P55286	799 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	NOMO3	P69849	1222 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CENPC	Q03188	943 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	C2orf54	Q08AI8	447 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	LMAN2	Q12907	356 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MYO1E	Q12965	1108 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ORC1	Q13415	861 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	MESD	Q14696	234 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	ZBTB6	Q15916	424 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RACK1-231	ENST00000514183	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.01	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms