RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 KIF3BO15066 747 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TRIM27P14373 513 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 GABRB3P28472 473 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 VPS41P49754 854 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SEMA3BQ13214 749 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 GAB1Q13480 694 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 OR2W5A6NFC9 320 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PRYO14603 147 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 KCNAB3O43448 404 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 USP12O75317 370 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 VIPP01282 170 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MYL3P08590 195 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ALADP13716 330 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 EGR1P18146 543 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MATN1P21941 496 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MMP8P22894 467 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 HOXD12P35452 270 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 IDUAP35475 653 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ME1P48163 572 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MTA1Q13330 715 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FHL1Q13642 323 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ATP1A4Q13733 1029 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TWIST1Q15672 202 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ELF2Q15723 593 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 P3H1Q32P28 736 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FAM209BQ5JX69 171 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PJA1Q8NG27 643 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 P2RY11Q96G91 374 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 GDF15Q99988 308 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 WACQ9BTA9 647 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 POT1Q9NUX5 634 aa4.8□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NCK2O43639 380 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 ST6GAL1P15907 406 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RPS6KB1P23443 525 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TNFSF4P23510 183 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NDUFS1P28331 727 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 MTX1Q13505 466 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PMS2P11Q13670 270 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TRMOQ9BU70 441 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RGL1Q9NZL6 768 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FAM234BA2RU67 622 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 AGTR2P50052 363 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ACSM6Q6P461 480 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FAM57BQ71RH2 274 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 UEVLDQ8IX04 471 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.78□□□□□ -1.64
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