RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSCR3O14972 297 aa5.28□□□□□ -1.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP1P28562 367 aa5.28□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THBS4P35443 961 aa5.28□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MATN1P21941 496 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPM1AP35813 382 aa5.25□□□□□ -1.57
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELF2Q15723 593 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNGA3Q16281 694 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIP5K1BO14986 540 aa5.24□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANXA6P08133 673 aa5.24□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFS1P28331 727 aa5.24□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TACR3P29371 465 aa5.24□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXD12P35452 270 aa5.24□□□□□ -1.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
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