RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492778.5

CRAMP1-207, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 573 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1-207ENST00000492778 RNF214Q8ND24 703 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 NETO1Q8TDF5 533 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 DDI1Q8WTU0 396 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PIGKQ92643 395 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ACP6Q9NPH0 428 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 EBF1Q9UH73 591 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 HCN2Q9UL51 889 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PTPRDP23468 1912 aa9.27□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 IGF2RP11717 2491 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CYBBP04839 570 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ZNF806P0C7X5 589 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SDHBP21912 280 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 NTSR1P30989 418 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PPP1R2P41236 205 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PTGER3P43115 390 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 NUMBP49757 651 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 IQCB1Q15051 598 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PPM1JQ5JR12 505 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 RNF43Q68DV7 783 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 RASSF3Q86WH2 238 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 UBR7Q8N806 425 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ADAM32Q8TC27 787 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SPACA7Q96KW9 195 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 RTKNQ9BST9 563 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CIPCQ9C0C6 399 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CD93Q9NPY3 652 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.26□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 A0A0A0MRY4 1105 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 C4orf47A7E2U8 309 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC30A4O14863 429 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CACNG3O60359 315 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 LRP3O75074 770 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GABBR2O75899 941 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CISD3P0C7P0 127 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SETSIPP0DME0 302 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GABRG2P18507 467 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 CHKAP35790 457 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 MAPK8P45983 427 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 DAOAP59103 153 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 ARID5AQ03989 594 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GEN1Q17RS7 908 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 STPG1Q5TH74 334 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 FYB2Q5VWT5 728 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PMS2CLQ68D20 193 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 LMO3Q8TAP4 145 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 GOLGA1Q92805 767 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 LOXL4Q96JB6 756 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.25□□□□□ -0.93
CRAMP1-207ENST00000492778 EDEM2Q9BV94 578 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms