RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TTC22Q5TAA0 569 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 THAP4Q8WY91 577 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CPT1BQ92523 772 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 VPS16Q9H269 839 aa5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 KIF28PB7ZC32 967 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 H0Y3Z8 333 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SLPIP03973 132 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SOX10P56693 466 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LMAN2Q12907 356 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CAGE1Q8TC20 777 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 HMGB4Q8WW32 186 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 C3orf49Q96BT1 292 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FAR2Q96K12 515 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 VPS45Q9NRW7 570 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 KAT6AQ92794 2004 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 A0A087X1B8 175 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SUV39H1O43463 412 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 RAMP2O60895 175 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PDE8BO95263 885 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 BDNFP23560 247 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FPR3P25089 353 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CACNA2D1P54289 1103 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CBFBQ13951 182 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 RPS6KA2Q15349 733 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FAM187BQ17R55 369 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PCGF5Q86SE9 256 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SNX18Q96RF0 628 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TIMP4Q99727 224 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MRIQ9BWK5 157 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 USP29Q9HBJ7 922 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 M0QZQ0 153 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 MGST3O14880 152 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 ALADP13716 330 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 MATN1P21941 496 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 THBS4P35443 961 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 HMGA2P52926 109 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 PRKAA2P54646 552 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 CYP4F2P78329 520 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 GPC5P78333 572 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 CFHR3Q02985 330 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 CUL4BQ13620 913 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 EFR3AQ14156 821 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 AAK1Q2M2I8 961 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 CEP85Q6P2H3 762 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 ACSM6Q6P461 480 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL20-204ENST00000489160 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.64□□□□□ -1.51
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