RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MOB2Q70IA6 237 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAR2Q96K12 515 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ENDOD1O94919 500 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CKMP06732 381 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RHOCP08134 193 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KRT16P08779 473 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SPATA17Q96L03 361 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 THRAP10827 490 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 APOPT1Q96IL0 206 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GPAMQ9HCL2 828 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 AAASQ9NRG9 546 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.31■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 B4GALT5O43286 388 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GJB1P08034 283 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CALB2P22676 271 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CSHL1Q14406 222 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LRRC19Q9H756 370 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HACD1B0YJ81 288 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PGAM1P18669 254 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TBX4P57082 545 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RCN1Q15293 331 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RIPK3Q9Y572 518 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LIASO43766 372 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KCNA3P22001 575 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 VHLP40337 213 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAAP100Q0VG06 881 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 WWOXQ9NZC7 414 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LTFP02788 710 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SHBGP04278 402 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 USP17L7P0C7H9 530 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TUBP50607 506 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TREML2Q5T2D2 321 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CEP19Q96LK0 163 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.3■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HGSNATQ68CP4 663 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ILDR2Q71H61 639 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MREGQ8N565 214 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SEMA4DQ92854 862 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 BATF3Q9NR55 127 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 OPLAHO14841 1288 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 OCA2Q04671 838 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CES3Q6UWW8 571 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RBP1P09455 135 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 VPS28Q9UK41 221 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CRTAMO95727 393 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HOXC6P09630 235 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 BDNFP23560 247 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NPNTQ6UXI9 565 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GLP2RO95838 553 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CBX4O00257 560 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NOL4O94818 638 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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