RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LILRA2Q8N149 483 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA18Q8TC71 538 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RANBP9Q96S59 729 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RMI1Q9H9A7 625 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MATN2O00339 956 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDGFRBP09619 1106 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COX4I2Q96KJ9 171 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNPOQ9NVS9 261 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.41■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1B0GTW7 788 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM247A6NEH6 219 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRCH4O75427 683 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZMPSTE24O75844 475 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE6P0CI01 402 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMC3P17980 439 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HOXD12P35452 270 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF132P52740 706 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCP10Q12799 353 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPP2Q13103 211 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMIGD2Q96BF3 282 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSRNP1Q96S65 589 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COA1Q9GZY4 146 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRK2P25098 689 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BSNDQ8WZ55 320 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SORT1Q99523 831 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS28Q9UK41 221 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.4■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.39■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM159BA6NKW6 160 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCXO43602 365 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STAM2O75886 525 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UGCGQ16739 394 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBR7Q8N806 425 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NLRP7Q8WX94 980 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC39Q96DD0 335 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAF1Q9H063 256 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.39■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H0YJX3 145 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCY6O43306 1168 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TUBA4AP68366 448 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLF10Q13118 480 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FLOT2Q14254 428 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDK1Q15118 436 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCTD6Q8NC69 237 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAK5Q9P286 719 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EMCNQ9ULC0 261 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BBOX1O75936 387 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTFP26441 200 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GJA8P48165 433 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACAP1Q15027 740 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf46Q6P387 395 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf89Q6UX73 402 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUF2Q9BZD4 464 aa23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HTR3EA5X5Y0 456 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H6PDO95479 791 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HALP42357 657 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TGFBIQ15582 683 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DLG3Q92796 817 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKP2Q99959 881 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRJQ12913 1337 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLRA3O75311 464 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL6A2P12110 1019 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNA4P22459 653 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WNT7BP56706 349 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTN2Q02246 1040 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOMO1Q15155 1222 aa23.37■■□□□ 1.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms