RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnpla5Q32LZ8 432 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pld5Q3UNN8 536 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc9Q3V038 219 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga1Q3V3R4 1179 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PighQ5M9N4 188 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdpd5Q640M6 607 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scube1Q6NZL8 1018 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc27Q80YS5 523 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt5Q8C102 930 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Agbl2Q8CDK2 862 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Colgalt1Q8K297 617 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prkag2Q91WG5 566 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Def8Q99J78 448 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map4k3Q99JP0 894 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgm3Q9CYR6 542 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst7Q9EP78 484 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nme3Q9WV85 169 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts6D3Z1A5 1117 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsta3P30115 221 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr2c2P49117 596 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YwhazP63101 245 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdcd1Q02242 288 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DgkqQ6P5E8 934 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf168Q80XJ2 565 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk32aQ8BGW6 398 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl24Q8CCB5 363 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eva1bQ8K2Y3 164 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstm4Q8R5I6 218 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IrgqQ8VIM9 583 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmco4Q91WU4 631 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhga10Q91XY9 930 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TtpalQ9D3D0 343 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dmap1Q9JI44 468 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erich2E9Q1A6 463 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Farp1F8VPU2 1048 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr611K7N609 323 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr612L7N462 323 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt10P02535 570 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elk4P41158 430 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr23Q7TRX4 325 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbx10Q810F8 385 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SowahaQ8BLS7 548 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim61Q8JZK6 461 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 McmbpQ8R3C0 642 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpp3Q99KK7 738 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f14Q9EP75 524 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbk1Q9WUN2 729 aa16.54■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb4A2A863 1818 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f17G3UW78 524 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabrb2P63137 512 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp9bP98195 1146 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkcqQ02111 707 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc38a5Q3U1J0 479 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WtipQ7TQJ8 398 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TdrpQ8C5P7 182 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wrnip1Q91XU0 660 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f16Q99N17 524 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PompQ9CQT5 141 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smok3cA0A087WSF2 504 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mroh4G3X8W1 983 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NyxP83503 476 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk7Q03147 346 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfm4Q3UZZ4 505 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubxn7Q6P5G6 467 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35f5Q8R314 524 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Isl2Q9CXV0 359 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim54Q9ERP3 366 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn3A2ALK8 913 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2610028H24RikG5E8K1 270 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ShdO88834 343 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntn3Q07409 1028 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elf3Q3UPW2 391 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgprb8Q7TN51 330 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tdp1Q8BJ37 609 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gjd4Q8BSD4 364 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mark4Q8CIP4 752 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glis2Q8VDL9 521 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdgfdQ925I7 370 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl35Q9CZ49 574 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Noxred1Q9D3S5 366 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PolhQ9JJN0 694 aa16.53■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb3O54890 787 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcaf15Q6PFH3 600 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf276Q8CE64 614 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms