RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	STRN	O43815	780 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	C1QA	P02745	245 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CSH1	P0DML2	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CSH2	P0DML3	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TSHR	P16473	764 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	EPHB2	P29323	1055 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NEK3	P51956	506 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SBF1	O95248	1867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN5	O00501	218 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CYB561D2	O14569	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SPAG6	O75602	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KRT37	O76014	449 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ALAD	P13716	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB4	P48594	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RABGGTB	P53611	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BCAT1	P54687	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HIC1	Q14526	733 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	APOE	P02649	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB3	P29508	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SNX16	P57768	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	IRX4	P78413	519 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC18A2	Q05940	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARFIP2	P53365	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CREB3	O43889	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN9	P43378	593 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFV1	P49821	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DERA	Q9Y315	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5H	O75947	161 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BEST1	O76090	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KIT	P10721	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SULT1E1	P49888	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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