RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SPATA18Q8TC71 538 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TFAP2BQ92481 460 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MYLPFQ96A32 169 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TSPY26PQ9H489 355 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CISHQ9NSE2 258 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF358Q9NW07 568 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 EHD2Q9NZN4 543 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAM170AA1A519 330 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 C2orf78A6NCI8 922 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SOBPA7XYQ1 873 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 A8MXQ7 604 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TULP2O00295 520 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LCE2BO14633 110 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 P4HA2O15460 535 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TADA3O75528 432 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GNA14O95837 355 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 EGFP01133 1207 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CD58P19256 250 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DRD1P21728 446 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ATICP31939 592 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GALK1P51570 392 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 AP3M2P53677 418 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 JAM2P57087 298 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FANCCQ00597 558 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CCINQ13939 588 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NR1I3Q14994 352 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SYCP1Q15431 976 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 VSTM1Q6UX27 236 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ACOT1Q86TX2 421 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TTC30AQ86WT1 665 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SHC3Q92529 594 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TAF4BQ92750 862 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NELL1Q92832 810 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CD101Q93033 1021 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ATP2A3Q93084 1043 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PCED1BQ96HM7 432 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MED10Q9BTT4 135 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ECT2Q9H8V3 914 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 HPS4Q9NQG7 708 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 ATP8B3O60423 1300 aa6.2□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 A6NJY4 79 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 HHLA1C9JL84 531 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 F8VP50 259 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 K7ESF4 209 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 LRP3O75074 770 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 NFATC1O95644 943 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 TDGF1P13385 188 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GBP1P32455 592 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 GJA4P35212 333 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 MAGEA11P43364 429 aa6.19□□□□□ -1.42
LINC00963-215ENST00000622972 DGKEP52429 567 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms