RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MRGBPQ9NV56 204 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 E2F8A0AVK6 867 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MCF2LO15068 1137 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TBX3O15119 743 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL41O60662 606 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SLITRK3O94933 977 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD2P08910 425 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ADSSP30520 456 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LAMB2P55268 1798 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ARPC4P59998 168 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BCL2A1Q16548 175 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CCNG2Q16589 344 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PALM2Q8IXS6 379 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AGR3Q8TD06 166 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WWP1Q9H0M0 922 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 THEGQ9P2T0 379 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SGK1O00141 431 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GIPC1O14908 333 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2C9P11712 490 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KLRC2P26717 231 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EPHA3P29320 983 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PCYT1AP49585 367 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 COPAP53621 1224 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NR1D2Q14995 579 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CRY2Q49AN0 593 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FGD3Q5JSP0 725 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TDRPQ86YL5 185 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AHI1Q8N157 1196 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SLCO2A1Q92959 643 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 E2F7Q96AV8 911 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RANBP9Q96S59 729 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PKP2Q99959 881 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WDR70Q9NW82 654 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NYAP2Q9P242 653 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 VAV3Q9UKW4 847 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ITM2BQ9Y287 266 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NFIBO00712 420 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 COPEO14579 308 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 AIM2O14862 343 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ARP10275 920 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC3P17980 439 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ITGAXP20702 1163 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ETV4P43268 484 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 FMO1Q01740 532 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 BFSP1Q12934 665 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 NME3Q13232 169 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 EFHC2Q5JST6 749 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 FAM209AQ5JX71 171 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 GPR107Q5VW38 600 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 CENPUQ71F23 418 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 DDI1Q8WTU0 396 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ACSS2Q9NR19 701 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC130P13994 396 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 GMPRP36959 345 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 NEK2P51955 445 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 HIF1AQ16665 826 aa8.46□□□□□ -1.06
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