RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TISP43B9A030 160 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 B9A039 149 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF185O15231 689 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PDE8BO95263 885 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POLBP06746 335 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CNTFP26441 200 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PCSK1P29120 753 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPAN7P41732 249 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TGFB2P61812 414 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DDR1Q08345 913 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PGS1Q32NB8 556 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF529Q6P280 563 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 AMER2Q8N7J2 671 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HDAC10Q969S8 669 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DOCK2Q92608 1830 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM170AA1A519 330 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POMCP01189 267 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATP1A3P13637 1013 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DDCP20711 480 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HTR1BP28222 390 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ADORA1P30542 326 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GALNSP34059 522 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KRT9P35527 623 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PTPAQ15257 358 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CCNG2Q16589 344 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CRY2Q49AN0 593 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PRR5LQ6MZQ0 368 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF627Q7L945 461 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CNTROBQ8N137 903 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ASB12Q8WXK4 309 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PHKBQ93100 1093 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RILPL2Q969X0 211 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 MLST8Q9BVC4 326 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TEX101Q9BY14 249 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LTBP1Q14766 1721 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CAPN8A6NHC0 703 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 B4E171 279 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MGEA5O60502 916 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 AMY1AP04745 511 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UBA7P41226 1012 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 WASP42768 502 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CREMQ03060 361 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MTM1Q13496 603 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 ATP2B3Q16720 1220 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 RSPH3Q86UC2 560 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PRR18Q8N4B5 295 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA1Q92805 767 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-214ENST00000530727 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NEU1Q99519 415 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 BRD9Q9H8M2 597 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TDP1Q9NUW8 608 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TSPY2A6NKD2 308 aa4.61□□□□□ -1.67
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