RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528320.5

PUF60-212, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-212ENST00000528320 RNF38Q9H0F5 515 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-212ENST00000528320 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-212ENST00000528320 GKN1Q9NS71 199 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-212ENST00000528320 EHD2Q9NZN4 543 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-212ENST00000528320 PJA2O43164 708 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 AKR1B10O60218 316 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ATG13O75143 517 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 USP17L7P0C7H9 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CCDC130P13994 396 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SOX5P35711 763 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 KIF11P52732 1056 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 VAV2P52735 878 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 GCNT1Q02742 428 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 USP4Q13107 963 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ORC1Q13415 861 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 MTF1Q14872 753 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLC18A3Q16572 532 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 INTUQ9ULD6 942 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 F8VZ95 297 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 HDCP19113 662 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 YWHAQP27348 245 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 HOXC13P31276 330 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 PGFP49763 221 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 LIMK1P53667 647 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RAD23BP54727 409 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 MFAP3P55082 362 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 KIF5AQ12840 1032 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RUNX3Q13761 415 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TTC39CQ8N584 583 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 GAB3Q8WWW8 586 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 NT5C1BQ96P26 610 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ARID3AQ99856 593 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 186.3
PUF60-212ENST00000528320 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 LAMA1P25391 3075 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 AP1G2O75843 785 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ZNF806P0C7X5 589 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLC5A3P53794 718 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 AMPD2Q01433 879 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 EML3Q32P44 896 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 KIAA1328Q86T90 577 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 KRT82Q9NSB4 513 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CISHQ9NSE2 258 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 AXIN1O15169 862 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TUBP50607 506 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 PDE6CP51160 858 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 PDGFRLQ15198 375 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ST3GAL2Q16842 350 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 GAB4Q2WGN9 574 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 IL31Q6EBC2 164 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ZNF276Q8N554 614 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 DESI2Q9BSY9 194 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 EBF3Q9H4W6 596 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 USP3Q9Y6I4 520 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-212ENST00000528320 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms