RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS23O95084 383 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MT-CO1P00395 513 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PDHBP11177 359 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CXCR5P32302 372 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLC1A4P43007 532 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NOVP48745 357 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BACE1P56817 501 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 EVCP57679 992 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BECN1Q14457 450 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GRM4Q14833 912 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC181Q5TID7 509 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GPR149Q86SP6 731 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ERO1BQ86YB8 467 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMTC2Q8N394 836 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL16Q8N461 479 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FITM2Q8N6M3 262 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GTF3C6Q969F1 213 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RAB24Q969Q5 203 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 AIFM3Q96NN9 605 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VCPKMTQ9H867 229 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MKS1Q9NXB0 559 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MAD2L2Q9UI95 211 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMX2Q9Y320 296 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PHIPQ8WWQ0 1821 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PCSK5Q92824 1860 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KLRF2D3W0D1 207 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CYTH3O43739 400 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 AMY1AP04745 511 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CKBP12277 381 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TYRP1P17643 537 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G5P39877 138 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MCM2P49736 904 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A1P53985 500 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PPATQ06203 517 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF543Q08ER8 600 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FOXI1Q12951 378 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CUL4AQ13619 759 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TREML2Q5T2D2 321 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RSPH3Q86UC2 560 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 Q96MF0 132 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PIGSQ96S52 555 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CASS4Q9NQ75 786 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC78A2IDD5 438 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFS2O75306 463 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FLOT1O75955 427 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ESRRBO95718 433 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CALM1P0DP23 149 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CALM2P0DP24 149 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CALM3P0DP25 149 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SNHG28P0DPA3 235 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MYBL2P10244 700 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VCAM1P19320 739 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GJB2P29033 226 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KIF5BP33176 963 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NT5C2P49902 561 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP1BP68106 108 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PPIL2Q13356 520 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCL15Q16663 113 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RGMBQ6NW40 437 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC174Q6PII3 467 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PNKPQ96T60 521 aa5.37□□□□□ -1.55
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