RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 MIIPQ5JXC2 388 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 IRGQQ8WZA9 623 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 SIX2Q9NPC8 291 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA7Q8IZY2 2146 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXB3-202ENST00000460160 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 RNF139Q8WU17 664 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 BHMTQ93088 406 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 PLD4Q96BZ4 506 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 NDST4Q9H3R1 872 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 MEA1Q16626 185 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CEP68Q76N32 757 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 SGK1O00141 431 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO21O94952 628 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CHKAP35790 457 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CRY1Q16526 586 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 VWA3BQ502W6 1294 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 PLK2Q9NYY3 685 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 HCN2Q9UL51 889 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 MED7O43513 233 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM23O75077 832 aa24.74■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 KCNJ12Q14500 433 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FYB2Q5VWT5 728 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 MIS12Q9H081 205 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 RETP07949 1114 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CISD3P0C7P0 127 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TGM1P22735 817 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 USP8P40818 1118 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 DGKEP52429 567 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 CPXM2Q8N436 756 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ST7Q9NRC1 585 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO10Q9UK96 956 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.73■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 DGKGP49619 791 aa24.72■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 STK32AQ8WU08 396 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.72■■□□□ 1.55
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HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 PRRT4C9JH25 899 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 FYNP06241 537 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 ACADSBP45954 432 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB3-202ENST00000460160 EOGTQ5NDL2 527 aa24.71■■□□□ 1.55
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