RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.98■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HRO43593 1189 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GREM1O60565 184 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTFP02788 710 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PON1P27169 355 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTK2Q05397 1052 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MEA1Q16626 185 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SDE2Q6IQ49 451 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALLCQ8N6M5 410 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPT2Q8TD30 523 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLK2Q9NYY3 685 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP18Q9UMW8 372 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEP83Q9Y592 693 aa16.97■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAPN9O14815 690 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLKB1P03952 638 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCAM1P13591 858 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRY1Q16526 586 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANO7Q6IWH7 933 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDI1Q8WTU0 396 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NOX5Q96PH1 765 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANO10Q9NW15 660 aa16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0A0MRY4 1105 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RETP07949 1114 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GBP1P32455 592 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT9P35527 623 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPD2P43304 727 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNX16P57768 344 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF445P59923 1031 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ELF2Q15723 593 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STX1AQ16623 288 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHPFQ8IZ52 775 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGBD3Q8N328 593 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STK32AQ8WU08 396 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SHC3Q92529 594 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EBF1Q9UH73 591 aa16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXC13P31276 330 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC11A2P49281 568 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BPIFB4P59827 614 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APBA1Q02410 837 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MESP2Q0VG99 397 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 E2F5Q15329 346 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MPPE1Q53F39 396 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EMC10Q5UCC4 262 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf74Q86VG3 221 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPXM2Q8N436 756 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINB11Q96P15 392 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.94■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BECN2A8MW95 431 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SGK1O00141 431 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RHOBTB1O94844 696 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LATS1O95835 1130 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXB2P14652 356 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NTSR1P30989 418 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBX4P57082 545 aa16.93■□□□□ 0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARID5AQ03989 594 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms