RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 COL10A1Q03692 680 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 BIRC3Q13489 604 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNJ12Q14500 433 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 DENND2CQ68D51 928 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTC30AQ86WT1 665 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CPXCR1Q8N123 301 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 VPS50Q96JG6 964 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 MMS19Q96T76 1030 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 AGAP2Q99490 1192 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 AP4M1O00189 453 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 QSOX1O00391 747 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP6R2O75170 966 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM155BO75949 473 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 FGAP02671 866 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 GYS1P13807 737 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PROZP22891 400 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP2C18P33260 490 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADD2P35612 726 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCM2P49736 904 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCT8P50990 548 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRKAA2P54646 552 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARL4CP56559 192 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 LMAN2Q12907 356 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPFIA1Q13136 1202 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNASE1L3Q13609 305 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM187BQ17R55 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 TIGD6Q17RP2 521 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 RINLQ6ZS11 566 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 P3H2Q8IVL5 708 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPIPB3Q92617 1050 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SARAFQ96BY9 339 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 UROC1Q96N76 676 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTPALQ9BTX7 342 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 RASSF1Q9NS23 344 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 GJD2Q9UKL4 321 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC189A1A4V9 331 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIF28PB7ZC32 967 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 H0Y3Z8 333 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 H7C1Q1 480 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 M0QZQ0 153 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 CES2O00748 559 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 RHOBTB3O94955 611 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 CER1O95813 267 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 TK1P04183 234 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 MATN1P21941 496 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 YY1P25490 414 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 CXCR5P32302 372 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP4F2P78329 520 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 DEUP1Q05D60 604 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 EFR3AQ14156 821 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms