RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 RUNDC1Q96C34 613 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZPBPQ9BS86 351 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CDH19Q9H159 772 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 VPS45Q9NRW7 570 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 DKK4Q9UBT3 224 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 VPS51Q9UID3 782 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 C4orf47A7E2U8 309 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CA12O43570 354 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRT86O43790 486 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 NDUFB8O95169 186 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 FGF2P09038 288 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB27AP51159 221 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 DGKQP52824 942 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TTC3P53804 2025 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CACNB3P54284 484 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 EPHB1P54762 984 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ANAPC15P60006 121 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZXDBP98169 803 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 RHDQ02161 417 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MTA1Q13330 715 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRT81Q14533 505 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CNGA3Q16281 694 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF585BQ52M93 769 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 LCE1EQ5T753 118 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDXDC1Q6P996 788 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 UEVLDQ8IX04 471 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 P2RY11Q96G91 374 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CHST8Q9H2A9 424 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SELENONQ9NZV5 590 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 L1RE1Q9UN81 338 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ICKQ9UPZ9 632 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 COL15A1P39059 1388 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPTLC2O15270 562 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 IGSF3O75054 1194 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 WDR47O94967 919 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 EPN2O95208 641 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 NGFRP08138 427 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 HTR7P34969 479 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 KCNJ4P48050 445 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PPATQ06203 517 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 DNASE1L3Q13609 305 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 KCNAB1Q14722 419 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF479Q96JC4 524 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MEIS3Q99687 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZIM2Q9NZV7 527 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 COL20A1Q9P218 1284 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 COG5Q9UP83 839 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 HPSEQ9Y251 543 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 TTC34A8MYJ7 566 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC28A2O43868 658 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDGFRBP09619 1106 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ST6GAL1P15907 406 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 VPS41P49754 854 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 FMO1Q01740 532 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 HYAL1Q12794 435 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 MTAPQ13126 283 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 PTGR1Q14914 329 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-890P-201ENST00000384121 ASIC2Q16515 512 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms