RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263857.10

POLR1A-201, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR1A, Length 12,749 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-201ENST00000263857 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 RAD54LQ92698 747 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 RIT1Q92963 219 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 VCPKMTQ9H867 229 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 A0A0D9SFI3 127 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 MAGEB2O15479 319 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 DHFRP00374 187 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 WEE2P0C1S8 567 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 TPBGLP0DKB5 382 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 MUTP22033 750 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 RENBPP51606 427 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 RBP5P82980 135 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 LLGL1Q15334 1064 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 DHFR2Q86XF0 187 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 CCDC115Q96NT0 180 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 SEC24AO95486 1093 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 MYBL2P10244 700 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 ITGA2P17301 1181 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 ACTR3P61158 418 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 SMYD1Q8NB12 490 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 KIF12Q96FN5 646 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 EVPLQ92817 2033 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-201ENST00000263857 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ERCC2P18074 760 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 NTSP30990 170 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 GTF2H1P32780 548 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PNPLA4P41247 253 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 RALGDSQ12967 914 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ABRQ12979 859 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 LRRC41Q15345 812 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 BOLA3Q53S33 107 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 BNIPLQ7Z465 357 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 SKA1Q96BD8 255 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 REREQ9P2R6 1566 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 SNAP23O00161 211 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 CCNB2O95067 398 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MYL3P08590 195 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 TUBA1BP68363 451 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MYBPC3Q14896 1274 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PTGISQ16647 500 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 TUBA1AQ71U36 451 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 UPB1Q9UBR1 384 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ATP9BO43861 1147 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 CHRNGP07510 517 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PDGFRBP09619 1106 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ITGA3P26006 1051 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PTPN7P35236 360 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 OMPP47874 163 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 OXCT1P55809 520 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ACAP2Q15057 778 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MED13LQ71F56 2210 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 CPB1P15086 417 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 OSTNP61366 133 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MEA1Q16626 185 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 HPS4Q9NQG7 708 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 CHL1O00533 1208 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 REM1O75628 298 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 GJA8P48165 433 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 NEDD8Q15843 81 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 CST11Q9H112 138 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 H3BN98 237 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-201ENST00000263857 PGRMC2O15173 223 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms