RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 SNTNA6NMZ2 147 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RFX3P48380 749 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 NDST1P52848 882 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 IKBKEQ14164 716 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ANGPT1Q15389 498 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 CCDC142Q17RM4 750 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KAZALD1Q96I82 304 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 WDR41Q9HAD4 459 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TOMM70O94826 608 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 GLP2RO95838 553 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 SLC16A1P53985 500 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 BEX3Q00994 111 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 NLNQ9BYT8 704 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TMEM245Q9H330 911 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TFR2Q9UP52 801 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 RASSF9O75901 435 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 LAYNQ6UX15 382 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 IDI2Q9BXS1 227 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-221ENST00000615025 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NBNO60934 754 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 YWHAQP27348 245 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CNTN2Q02246 1040 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CCDC126Q96EE4 140 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TIMM44O43615 452 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GLRA3O75311 464 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 JCHAINP01591 159 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PCNAP12004 261 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 INHBEP58166 350 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ADIGQ0VDE8 80 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ECSITQ9BQ95 431 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 A0A087X0T9 212 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM228BP0C875 321 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CYP2F1P24903 491 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PSMC6P62333 389 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 P3H2Q8IVL5 708 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 EMC1Q8N766 993 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 VMP1Q96GC9 406 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF333Q96JL9 665 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PLA2G6O60733 806 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CABYRO75952 493 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MSH3P20585 1137 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 IGFBP4P22692 258 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MYBPC2Q14324 1141 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GALNTL6Q49A17 601 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RETSATQ6NUM9 610 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAR2Q96K12 515 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 USE1Q9NZ43 259 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 BCL9O00512 1426 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 LACTBL1A8MY62 500 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 F8VZ95 297 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 H0YC42 278 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZBTB39O15060 712 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GZMAP12544 262 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PTPRAP18433 802 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RRM1P23921 792 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLC29A2Q14542 456 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SV2AQ7L0J3 742 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms