RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKN2BP42772 138 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA8P53708 1063 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 GUCY1A3Q02108 690 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 OGDHQ02218 1023 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1EQ12965 1108 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD7Q6UXD7 560 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MICALCLQ6ZW33 695 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 XYLT1Q86Y38 959 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HEMGNQ9BXL5 484 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 DPP3Q9NY33 737 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 IPPQ9Y573 584 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 F8VP50 259 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 O00370 1275 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGRF2O14827 1237 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 INPPL1O15357 1258 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC4O95801 387 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD2P08910 425 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSAP10619 480 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA2P25787 234 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HPDP32754 393 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP13P45452 471 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX16P57768 344 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TAOK1Q7L7X3 1001 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 URGCPQ8TCY9 931 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CPB2Q96IY4 423 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF39Q9H2S5 420 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SMYD3Q9H7B4 428 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SMAPO00193 183 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TULP2O00295 520 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MICAL2O94851 1124 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SHBGP04278 402 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PCK1P35558 622 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 VCPP55072 806 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 NOTUMQ6P988 496 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ALLCQ8N6M5 410 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC52Q8N7C0 313 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC3O43617 180 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 GPD2P43304 727 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP14Q86W24 1093 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 AUTS2Q8WXX7 1259 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP10Q92851 521 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 GMNCA6NCL1 334 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 OASLQ15646 514 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 BBS12Q6ZW61 710 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC25Q96NG3 672 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PPCSQ9HAB8 311 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDH9Q9HC56 1237 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HES2Q9Y543 173 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 GJB6O95452 261 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 POMCP01189 267 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH2P05091 517 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP1GAPP47736 663 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT5P48643 541 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 IZUMO3Q5VZ72 239 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PCGF5Q86SE9 256 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC93AQ86WB7 457 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 VSIG1Q86XK7 387 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35B2Q8TB61 432 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CPXM1Q96SM3 734 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC77Q9BR77 488 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC134Q9H6E4 229 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNCQ9H7C4 482 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MIOSQ9NXC5 875 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LRCH4O75427 683 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH8P55286 799 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 MORF4L2Q15014 288 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT8L2Q96SF2 557 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 APOL5Q9BWW9 433 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-204ENST00000587718 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.51■■□□□ 1.83
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