RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ICA1	Q05084	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ALCAM	Q13740	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TNIP1	Q15025	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NFIL3	Q16649	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	COA7	Q96BR5	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	COL4A1	P02462	1669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP2K7	O14733	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RFPL3	O75679	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TDP2	O95551	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EYA4	O95677	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP10	P09238	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SCP2	P22307	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PTGS2	P35354	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	USP14	P54578	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CETN1	Q12798	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF460	Q14592	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MTF1	Q14872	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ACAP1	Q15027	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZRM9	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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