RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 C1QL1O75973 258 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FAM163BP0C2L3 166 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ACADMP11310 421 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-EP13747 358 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PLA2G2AP14555 144 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TPMTP51580 245 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TNNC1P63316 161 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 BNC1Q01954 994 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ALCAMQ13740 583 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FUT11Q495W5 492 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HTR3DQ70Z44 454 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 KCNK16Q96T55 309 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MED10Q9BTT4 135 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 NUP58Q9BVL2 599 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.65□□□□□ -0.86
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PTPRM-210ENST00000578916 GMIPQ9P107 970 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 NME7Q9Y5B8 376 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 KCNJ18B7U540 433 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CAPN9O14815 690 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 BMP15O95972 392 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CISD3P0C7P0 127 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 IDEP14735 1019 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ITPKBP27987 946 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 GRK6P43250 576 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 CASP5P51878 434 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF132P52740 706 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 WDR49Q8IV35 697 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 SNX19Q92543 992 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 BHMTQ93088 406 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 NXPE2Q96DL1 559 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM9Q9C026 710 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 PLK4O00444 970 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 NPC1O15118 1278 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TLR5O60602 858 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 CCT8P50990 548 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 KIF19Q2TAC6 998 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 INAVAQ3KP66 663 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 SV2BQ7L1I2 683 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 UCMAQ8WVF2 138 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 PLK2Q9NYY3 685 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 STK17AQ9UEE5 414 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 KALRNO60229 2985 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 KCNK3O14649 394 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHGA12O60330 932 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 GREM1O60565 184 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 AP1G2O75843 785 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TBX18O95935 607 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 JUPP14923 745 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TNNI1P19237 187 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 HNF1BP35680 557 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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