RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 MEA1Q16626 185 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ANO4Q32M45 955 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 IRGQQ8WZA9 623 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PNKPQ96T60 521 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 VPS16Q9H269 839 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 FANCLQ9NW38 375 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.07■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SLC12A8A0AV02 714 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 BECN2A8MW95 431 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 E7ENQ6 273 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GFRA3O60609 400 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 STC2O76061 302 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ACADSBP45954 432 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 EDEM1Q92611 657 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 MIS12Q9H081 205 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 APODP05090 189 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GPD2P43304 727 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SLC6A11P48066 632 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TYRO3Q06418 890 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KRT31Q15323 416 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GAB4Q2WGN9 574 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM25Q86YD3 366 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ACP6Q9NPH0 428 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.05■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GREM1O60565 184 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 BPIFB4P59827 614 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KCNMA1Q12791 1236 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 NAT16Q8N8M0 369 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 STK32AQ8WU08 396 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PLD4Q96BZ4 506 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PRR23AA6NEV1 266 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KAT7O95251 611 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 LTFP02788 710 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KRT9P35527 623 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SEC13P55735 322 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 KDSRQ06136 332 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 Q6ZNB5 142 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ACDQ96AP0 544 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 BBS2Q9BXC9 721 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 DEC1Q9P2X7 70 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GABBR2O75899 941 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TDGF1P13385 188 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CHKAP35790 457 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 GRIA2P42262 883 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 C12orf40Q86WS4 652 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 NELL1Q92832 810 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.02■■□□□ 1.12
SNAP23-216ENST00000568331 K7EQS6 105 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TULP3O75386 442 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 KLKB1P03952 638 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TYRP14679 529 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 C2orf27AQ580R0 203 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms