RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 SCAPQ12770 1279 aa7.4□□□□□ -1.22
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UBASH3B-203ENST00000526386 SEMA3BQ13214 749 aa7.4□□□□□ -1.22
UBASH3B-203ENST00000526386 TFDP2Q14188 446 aa7.4□□□□□ -1.22
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UBASH3B-203ENST00000526386 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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UBASH3B-203ENST00000526386 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.4□□□□□ -1.22
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UBASH3B-203ENST00000526386 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.4□□□□□ -1.22
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UBASH3B-203ENST00000526386 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.4□□□□□ -1.22
UBASH3B-203ENST00000526386 NFS1Q9Y697 457 aa7.4□□□□□ -1.22
UBASH3B-203ENST00000526386 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
UBASH3B-203ENST00000526386 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 COL6A3P12111 3177 aa7.4□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 H3BQF6 201 aa7.39□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 CAV1Q03135 178 aa7.39□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ODF2Q5BJF6 829 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 MFSD5Q6N075 450 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.39□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 RFX6Q8HWS3 928 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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UBASH3B-203ENST00000526386 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 LRRC45Q96CN5 670 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SNF8Q96H20 258 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SPATA17Q96L03 361 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FMO2Q99518 471 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.39□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 USP29Q9HBJ7 922 aa7.39□□□□□ -1.23
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