RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CHRDQ9H2X0 955 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SCML2Q9UQR0 700 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 USP34Q70CQ2 3546 aa15.48■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GABBR2O75899 941 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 FBXO21O94952 628 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GZMAP12544 262 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SKILP12757 684 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TNFAIP3P21580 790 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GABRB2P47870 512 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CCR3P51677 355 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 NRLP54845 237 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 AMPD2Q01433 879 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 VPS36Q86VN1 386 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PASD1Q8IV76 773 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 IRGQQ8WZA9 623 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MIS12Q9H081 205 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.47■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 FAM186AA6NE01 2351 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SHISA7A6NL88 538 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 30.2
BRMS1-204ENST00000525127 ZBED1O96006 694 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 USP17L7P0C7H9 530 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MMP8P22894 467 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CTHP32929 405 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TKTL1P51854 596 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GSDMDP57764 484 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MTAPQ13126 283 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 FZD5Q13467 585 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF276Q8N554 614 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 STKLD1Q8NE28 680 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 EXOC4Q96A65 974 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CPXM1Q96SM3 734 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GKN1Q9NS71 199 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.46■□□□□ 0.07
BRMS1-204ENST00000525127 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 CKMP06732 381 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 CHRNB1P11230 501 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 PFKLP17858 780 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 SCNN1AP37088 669 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 SOX9P48436 509 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 PSEN1P49768 467 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 RGS7P49802 495 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 TUBP50607 506 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ADIGQ0VDE8 80 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 TAF10Q12962 218 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 PDGFRLQ15198 375 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 NAA35Q5VZE5 725 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ERICH1Q86X53 443 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 SPC24Q8NBT2 197 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 TTC8Q8TAM2 541 aa15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BRMS1-204ENST00000525127 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms