RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX16P57768 344 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 DAOAP59103 153 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 APBA1Q02410 837 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 STK32AQ8WU08 396 aa22.08■■□□□ 1.13
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SH3BP2-210ENST00000505941 NOX5Q96PH1 765 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 PHOX2BQ99453 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 MIS12Q9H081 205 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP83Q9Y592 693 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.08■■□□□ 1.13
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SH3BP2-210ENST00000505941 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 E7ENQ6 273 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CHKAP35790 457 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 GPD2P43304 727 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 TSSK4Q6SA08 328 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZS52 159 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 EDEM1Q92611 657 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 PLD4Q96BZ4 506 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 SIX2Q9NPC8 291 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 DEC1Q9P2X7 70 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SMTNL1A8MU46 457 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF40O75150 1001 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 STC2O76061 302 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SATB1Q01826 763 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM25Q86YD3 366 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 ACDQ96AP0 544 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 BBS2Q9BXC9 721 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 R4GN57 208 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNA1HO95180 2353 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 BECN2A8MW95 431 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 OPRD1P41143 372 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 KCNMA1Q12791 1236 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 NAT16Q8N8M0 369 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 WBP2Q969T9 261 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN9O14815 690 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 UCHL3P15374 230 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 SLC6A11P48066 632 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 SYNCQ9H7C4 482 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 GREM1O60565 184 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 KAT7O95251 611 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-210ENST00000505941 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 LHX5Q9H2C1 402 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.03■■□□□ 1.12
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