RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 T-ENOLP0DO92 83 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TCF3P15923 654 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ALCAMQ13740 583 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM192Q8IY95 271 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 LILRB2Q8N423 598 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 USP29Q9HBJ7 922 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CBX6O95503 412 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SLCO1A2P46721 670 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CCT8P50990 548 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 NAA20P61599 178 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 BFSP1Q12934 665 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SNX17Q15036 470 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC153Q494R4 210 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 Q6ZNX1 250 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SCAIQ8N9R8 606 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PGM2Q96G03 612 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ZFP42Q96MM3 310 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 UROC1Q96N76 676 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GAD1Q99259 594 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PQC6 194 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SERPINB8P50452 374 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PRMT2P55345 433 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PTENP60484 403 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 KCNMA1Q12791 1236 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 RNF43Q68DV7 783 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GLMNQ92990 594 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 VPS50Q96JG6 964 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SELENONQ9NZV5 590 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.5□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 OTOFQ9HC10 1997 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ACKR2O00590 384 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PALMO75781 387 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 DGKIO75912 1065 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ADRB2P07550 413 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ITGA4P13612 1032 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 KRT10P13645 584 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PCSK6P29122 969 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ARL2P36404 184 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 EHHADHQ08426 723 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 INPP5DQ92835 1189 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CGREF1Q99674 301 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 PADI3Q9ULW8 664 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 E9PBE3 544 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 C2CD2LO14523 706 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 OGTO15294 1046 aa7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
ROBO1-211ENST00000498428 RECQL4O94761 1208 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms