RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876		K7EQS6	105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	LILRB5	O75023	590 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	FNTB	P49356	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MFAP3	P55082	362 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DAOA	P59103	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876		Q6ZNB5	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	EDEM1	Q92611	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM24	O15164	1050 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	THAP12	O43422	761 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	KAT7	O95251	611 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	KLKB1	P03952	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	GNA15	P30679	374 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	USP8	P40818	1118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	STIL	Q15468	1287 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ANO4	Q32M45	955 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SHC3	Q92529	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	BHMT	Q93088	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	PNKP	Q96T60	521 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TULP3	O75386	442 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	GPD2	P43304	727 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	NRL	P54845	237 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	GAD2	Q05329	585 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	MIS12	Q9H081	205 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	ATG13	O75143	517 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	MBD3	O95983	291 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	TYR	P14679	529 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	COG7	P83436	770 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	LPAL2	Q16609	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	STX1A	Q16623	288 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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