RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486243.1

IFT52-209, Transcript of intraflagellar transport 52, humanhuman

TSL 5

Gene IFT52, Length 256 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52-209ENST00000486243 ZNF580Q9UK33 172 aa3.41□□□□□ -1.86
IFT52-209ENST00000486243 FZD4Q9ULV1 537 aa3.41□□□□□ -1.86
IFT52-209ENST00000486243 HPSEQ9Y251 543 aa3.41□□□□□ -1.86
IFT52-209ENST00000486243 EID1Q9Y6B2 187 aa3.41□□□□□ -1.86
IFT52-209ENST00000486243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa3.41□□□□□ -1.86
IFT52-209ENST00000486243 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 AQP7P3A6NL99 342 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TOMM40O96008 361 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SCP2P22307 547 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 PEX2P28328 305 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CCKBRP32239 447 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 GALNSP34059 522 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ST3GAL2Q16842 350 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ANO7Q6IWH7 933 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 HIC2Q96JB3 615 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TM2D2Q9BX73 214 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.4□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CD8B2A6NJW9 211 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 VSTM5A8MXK1 200 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 H3BNX3 289 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZBED1O96006 694 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 MT-ND5P03915 603 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ALPLP05186 524 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CD19P15391 556 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TNFRSF1BP20333 461 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TACR3P29371 465 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 HTR6P50406 440 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 MTAPQ13126 283 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 MTX1Q13505 466 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 GPR162Q16538 588 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 JDP2Q8WYK2 163 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 VPS50Q96JG6 964 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SNX22Q96L94 193 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 LRP12Q9Y561 859 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SQORQ9Y6N5 450 aa3.39□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 A0A087WZ62 844 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 GOLIM4O00461 696 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 INPPL1O15357 1258 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TSPAN6O43657 245 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 SNX2O60749 519 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 WDR47O94967 919 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 PLAUP00749 431 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TMEM225BP0DP42 221 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CCKARP32238 428 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CPA2P48052 419 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 JAK3P52333 1124 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CLCA4Q14CN2 919 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TWIST1Q15672 202 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 P3H2Q8IVL5 708 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.38□□□□□ -1.87
IFT52-209ENST00000486243 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms