RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471635.5

RBM39-228, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-228	ENST00000471635	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635		H3BNX3	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MGEA5	O60502	916 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	INMT	O95050	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	RBL1	P28749	1068 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TWIST1	Q15672	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TPP1	O14773	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PSG1	P11464	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PEX2	P28328	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CPA2	P48052	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ME1	P48163	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	STIM1	Q13586	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	GOLIM4	O00461	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	INPPL1	O15357	1258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	GALNS	P34059	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	COPA	P53621	1224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HSF1	Q00613	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	GRM3	Q14832	879 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PIM3	Q86V86	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SNX22	Q96L94	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	RRH	O14718	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	WDR47	O94967	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	OAZ2	O95190	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZBED1	O96006	694 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MT-ND5	P03915	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	HTR7	P34969	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	JAK3	P52333	1124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FAM193A	P78312	1265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MTX1	Q13505	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-228	ENST00000471635	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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