RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 PRRT4C9JH25 899 aa20.37■□□□□ 0.85
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UBXN4-202ENST00000415164 CD58P19256 250 aa20.37■□□□□ 0.85
UBXN4-202ENST00000415164 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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UBXN4-202ENST00000415164 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.33■□□□□ 0.85
UBXN4-202ENST00000415164 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.33■□□□□ 0.85
UBXN4-202ENST00000415164 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.33■□□□□ 0.85
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.33■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1W2PQD8 194 aa20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 SH3BP5O60239 455 aa20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 KRT13P13646 458 aa20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 EFEMP1Q12805 493 aa20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.32■□□□□ 0.84
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.32■□□□□ 0.84
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